消毒是指杀死病原微生物、但不一定能杀死细菌芽孢的方法。通常用化学的方法来达到消毒的作用。用于用于消毒的化学药物叫做消毒剂。是使消毒剂与污水混合，进行消毒的构筑物。
污水处理厂常用消毒试剂：NaClO、液氯、CaClO等，其有效成分均为次氯酸根。
主要功能：杀死处理后污水中的病原性微生物。